化合物相似性，有時候也會說分子相似性，是指兩個分子或者化合物在結(jié)構(gòu)上的相似程度，而相似化合物一般在化學(xué)反應(yīng)上的效果類似，以及在生物活性（biological activity）上面也會有同樣的作用。
在計算化合物相似性的過程中，使用的是分子指紋（molecular fingerprint）來進(jìn)行比較。比較兩個化合物分子指紋時，最常用的是杰卡德系數(shù)（Tanimoto(or Jaccard) coefficient ）T來度量其相似程度。若兩個化學(xué)結(jié)構(gòu)的指紋的T>0.85，一般就視為相似的。
以相似性為基礎(chǔ)可以進(jìn)行虛擬篩選（virtual screening），是一種ligand-based的虛擬篩選，為了要在上百萬中化合物數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行高效的相似性篩選，通過使用指紋比對效率最為高效。
posted on 2011-06-30 14:13
周銳 閱讀(2717)
評論(1) 編輯 收藏 所屬分類:
Chemistry