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           Don't Repeat Yourself
          座右銘:you can lose your money, you can spent all of it, and if you work hard you get it all back. But if you waste your time, you're never gonna get it back.
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          化合物相似性,有時候也會說分子相似性,是指兩個分子或者化合物在結構上的相似程度,而相似化合物一般在化學反應上的效果類似,以及在生物活性(biological activity)上面也會有同樣的作用。
          在計算化合物相似性的過程中,使用的是分子指紋(molecular fingerprint)來進行比較。比較兩個化合物分子指紋時,最常用的是杰卡德系數(Tanimoto(or Jaccard) coefficient )T來度量其相似程度。若兩個化學結構的指紋的T>0.85,一般就視為相似的。
          以相似性為基礎可以進行虛擬篩選(virtual screening),是一種ligand-based的虛擬篩選,為了要在上百萬中化合物數據庫中進行高效的相似性篩選,通過使用指紋比對效率最為高效。
          posted on 2011-06-30 14:13 周銳 閱讀(2712) 評論(1)  編輯  收藏 所屬分類: Chemistry
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