首先，投資者向轉出券商提出轉托管申請，填寫“轉托管申請書”，在申請書中認真填寫轉出證券帳戶代碼、證券品種、數量等，務必注意填寫轉入券商的名稱及與其相符的席位號。轉出券商收到申請書后，認真核對投資者的身份證及申請書內容是否正確，核對無誤后，在交易時間內，通過交易系統向深交所報盤轉托管，當日停牌證券不可以轉托管，轉托管委托報盤后，在當日閉市前也可報盤申請撤單。
每個交易日收市后，深圳證券結算公司將處理后的轉托管數據打入“結算數據包”，通過結算通訊系統發給券商，券商根據所接收的轉托管數據及時修訂相應的股份明細帳。轉托管證券Ｔ＋１日（即次一交易日）到帳，投資者可在轉入證券商處委托賣出。轉出券商每次受理轉托管業務時，向投資者收取30元人民幣的轉托管費。轉托管成功后，投資者在原轉出券商處的深圳帳戶如不銷戶，仍可繼續使用，但還是要在哪兒買，哪兒賣，否則要辦轉托管。