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Posted on 2014-08-21 15:07 TWaver 閱讀(635) 評論(0) 編輯 收藏
生物信息資源更新越來越快,使用可視化的方法來分析DNA序列已成為生物信息學(xué)的一個研究熱點,用圖形表示DNA序列的方法也越來越成熟。2011年，著名雜志《Science》發(fā)表一篇引起轟動的文章:《Presenting the Human Genome:Now is 3D!》,這篇文章完全給我們描述了人類基因組測序未來的藍圖，可見3D技術(shù)在很多領(lǐng)域都是發(fā)展方向。
使用mono可以快速的創(chuàng)建DNA分子結(jié)構(gòu)立體模型，效果如下：
當(dāng)然簡單的呈現(xiàn)DNA分子結(jié)構(gòu)，僅僅是一部分功能，如果將mono和專業(yè)的DNA分析儀結(jié)合，不僅可以發(fā)現(xiàn)病癥，更重要的是預(yù)測病癥的發(fā)生，治病于未發(fā)，這將是人類的福音。除了研究人類基因之外，我們還可以對農(nóng)作物的進行DNA3D模型化，并加以分析，對農(nóng)業(yè)的發(fā)展和糧食安全方面都會有積極的意義。
使用mono創(chuàng)建3D模型最大的特點就是快，代碼不過幾十行，使用Editor更是不需要代碼量。本文的效果圖通過代碼實現(xiàn)，核心代碼如下： 1 | function createDNA(box, x, y, z, colors){ |
2 | var count=20+Math.random()*50; |
4 | var parent=createNode(box, 10, 0,0,0,'red'); |
5 | for(var i=0;i<count;i++){ |
6 | var angle=Math.PI*2/360*15*i; |
7 | var radius = (i % 2==0) ? 10 : 7; |
8 | var color = colors[i%2] |
9 | var node1=createPairNode(box, dist, radius, i, angle, color); |
10 | var node2=createPairNode(box, dist*0.3, radius, i, angle, color); |
11 | node1.setParent(parent); |
12 | node2.setParent(parent); |
15 | var link=createLink(box, node1, node2, dist, angle, 'gray'); |
16 | var node3=createPairNode(box, dist*0.58, radius*0.4, i, angle,'cyan'); |
17 | var node4=createPairNode(box, dist*0.72, radius*0.4, i, angle,'cyan'); |
18 | link.setParent(parent); |
19 | node3.setParent(parent); |
20 | node4.setParent(parent); |
23 | parent.setPosition(x,y,z); |
24 | parent.setStyle('m.visible',false); |
1 | function createPairNode(box, size, radius, index, angle, color){ |
2 | var x=size*Math.sin(angle); |
3 | var z=size*Math.cos(angle); |
5 | var node = createNode(box, radius, x, y, z, color); |
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