MapReduce 解析XML算法的一點(diǎn)構(gòu)思
沒(méi)想到Hadoop在解析XML時(shí)如此糾結(jié),以至于新版api的mapreduce竟然放棄了XML格式的format以及reader,在老版(hadoop-0.19.*)的streaming模塊提供了這樣的api,由于我用的hadoop-0.20.2 3U1版本,因此需要把處理XML的幾個(gè)類(lèi)移植過(guò)來(lái)使用。
移植所帶來(lái)的問(wèn)題是各處依賴(lài)包,和各種api不兼容。沒(méi)關(guān)系,我可以看一下源碼,然后自己寫(xiě)一個(gè)。細(xì)看了一下reader的代碼,發(fā)現(xiàn)mapreduce使用了BufferedInputStream的mark,reset來(lái)尋找XML的tag,這個(gè)tag就是我們?cè)谔峤蛔鳂I(yè)所設(shè)置的,比如<log>,</log>這樣的標(biāo)簽。Java中stream流的mark和reset,允許指針回讀,即在找到<log>時(shí),mark一下指針,然后再找到</log>標(biāo)簽,最后通過(guò)reset方法,返回到mark的位置,把<log></log>內(nèi)的數(shù)據(jù)讀取出來(lái)。但在匹配的過(guò)程中,我發(fā)現(xiàn)mapred使用了BufferedInputStream 的 read(); 方法,該方法返回下一個(gè)可讀的字節(jié)。那么整個(gè)處理過(guò)程就是讀一個(gè)字節(jié),比較一個(gè)字節(jié),我沒(méi)有在mapreduce中用這樣的算法,但我測(cè)試過(guò),向緩沖區(qū)(BufferedInputStream)中一個(gè)字節(jié)一個(gè)字節(jié)的讀,性能?chē)?yán)重不足,read(); 方法平均返回時(shí)間在331納秒,處理一個(gè)170M的xml文檔(tag比較多),竟然花了200+秒。(streaming模塊還寫(xiě)了一個(gè)faster*方法,哎,慢死了)
周敏同學(xué)提供了pig中處理xml的reader,但pig那邊的代碼我還沒(méi)細(xì)看,也不知道hadoop的jira中有沒(méi)有新的feature來(lái)解決現(xiàn)有xml的問(wèn)題。如果有的話(huà),不防可以告訴我一下下。呵呵。
現(xiàn)在有一個(gè)構(gòu)思,即主要思想仍然圍繞字節(jié)比較,因?yàn)樽址ヅ湫矢?,另外算法源于String.indexOf(“”),即找到<log>這個(gè)后,記住位置,然后再找</log>,這樣算完全匹配,中間的內(nèi)容用system.arraycopy來(lái)復(fù)制到新的字節(jié)數(shù)組,目前這算法我實(shí)現(xiàn)了一半,即找到<log>和</log>后,把這兩個(gè)簽標(biāo)全部替換掉,170M文檔,用時(shí)2.2秒(最快1.3秒)。
算法及問(wèn)題:
首先提供一個(gè)BufferedInputStream,默認(rèn)大小8k,在程序中建一個(gè)字節(jié)數(shù)組,大小為4k,即每次向BufferedInputStream讀4k,這個(gè)效率是很不錯(cuò)的,然后去尋找<log>.toArray這樣的字節(jié)數(shù)組,這一步速度是很驚人的。但這里有一個(gè)小的問(wèn)題,即每次讀4k的大小去處理,那很有可能<log></log>位于兩次讀取的一尾一頭,那么我的想法是做一個(gè)半循環(huán)的字節(jié)數(shù)組,即如果在4k的字節(jié)數(shù)組中的最后找到<log>,那么就把前面未匹配的仍掉,然后把<log>標(biāo)簽移到字節(jié)數(shù)組最前端,然后另用這個(gè)字節(jié)數(shù)組再向BufferedInputStream中去讀4k-5長(zhǎng)度的內(nèi)容(5是<log>的字節(jié)長(zhǎng)度)。關(guān)于4k這個(gè)大小,首先要對(duì)XML數(shù)據(jù)進(jìn)行sampling,即確定<log></log>當(dāng)中的內(nèi)容長(zhǎng)度,然后再定這個(gè)緩沖buf的大小。
posted on 2011-12-21 21:15 Ric Dong 閱讀(312) 評(píng)論(0) 編輯 收藏