1.用系統管理員登陸系統。 
2.停止MySQL的服務。 
3.進入命令窗口，然后進入MySQL的安裝目錄，比如我的安裝目錄是c:\mysql,進入C:\mysql\bin 
4.跳過權限檢查啟動MySQL， 
c:\mysql\bin>mysqld-nt --skip-grant-tables 
5.重新打開一個窗口，進入c:\mysql\bin目錄，設置root的新密碼 
c:\mysql\bin>mysqladmin -u root flush-privileges password "newpassword" 
c:\mysql\bin>mysqladmin -u root -p shutdown 
將newpassword替換為你要用的root的密碼，第二個命令會提示你輸入新密碼，重復第一個命令輸入的密碼。 
6.停止MySQL Server，用正常模式啟動Mysql 
7．你可以用新的密碼鏈接到Mysql了。 

Unix&Linux： 
1.用root或者運行mysqld的用戶登錄系統； 
2．利用kill命令結束掉mysqld的進程； 
3．使用--skip-grant-tables參數啟動MySQL Server 
shell>mysqld_safe --skip-grant-tables & 
4.為root@localhost設置新密碼 
shell>mysqladmin -u root flush-privileges password "newpassword"
5．重啟MySQL Server

轉于：http://blog.csdn.net/ssll2826/archive/2005/10/12/502259.aspx