解決：問谷老師得知是microsoft提供的數據庫驅動存在bug。需要換一種驅動連接，使用jtds（下載地址：http://sourceforge.net/projects/jtds/files/）下載jtds1.2版，解壓得到jtds-1.2.jar，引用到eclipse中項目目錄下（去除原驅動引用），更改hibernate配置文件：
原驅動連接配置：
<property name="connection.driver_class">com.microsoft.jdbc.sqlserver.SQLServerDriver</property>
<property name="connection.url">jdbc:microsoft:sqlserver://127.0.0.1:1433;DatabaseName=hibernate</property>
更改jtds連接：
<property name="connection.driver_class">net.sourceforge.jtds.jdbc.Driver</property>
<property name="connection.url">jdbc:jtds:sqlserver://127.0.0.1:1433;DatabaseName=hibernate</property>
問題得到解決。補充：java代碼調原驅動連接數據庫是沒有問題的，搭配hibernate會有此問題。
轉載自：http://blog.csdn.net/myloveyoyo1314/archive/2010/01/07/5152902.aspx
之前出現這個問題時一直沒在意,以為是重裝了系統后軟件中少了什么東西導致的,因為在連接mysql5.1時正常,連接sql2000時就是連不上,郁悶,終于在網上找到了解答,原來是sql驅動和hibernate的兼容性問題,現問題已解決,留此文備查.
本文來自CSDN博客，轉載請標明出處：http://blog.csdn.net/jsship/archive/2010/03/13/5377210.aspx